Medzizubná kefka už zo svojho názvu logicky určuje jej použitie. Používa sa na čistenie mezizubných priestorov, pretože práve na týchto miestach najčastejšie vzniká zubný kaz. Medzizubné kefky, sú zvyčajne veľmi malé a obsahujú osobitne navrhnuté kefy na čistenie medzi zubami.
Tieto kefky, sú najlepšie, keď medzery medzi zubami sú širšie a tak ich použitie je jednoduchšie. Vyskytujú sa v rôznych šírkach, veľkostiach a farbách aby zodpovedali priestoru medzi zubami.